nein, die Krankenkasse übernimmt die Kosten erst bei langfristiger Krankschreibung (ich glaube über (!) 6 Wochen, müsste ich aber nachschlagen), bei 2 Wochen ist definitiv der AG dran. Deer bekommt zwar dann einen Teil davon zurück, aber damit hast Du nichts zu tun, da müssen die sich drum kümmern.
Was den Rest angeht - kommt darauf an, was der Gehaltszettel dazu sagt.
Vielleicht sind die bei "1.100 netto" von falschen Voraussetzungen ausgegangen? Ist unüblich, dass der AG einen Netto-Lohn verspricht, der kennt ja Deine Lohnsteuerklasse (noch) nicht, er weiß (noch) nicht, ob Du vielleicht schon montliche Vorabzugsbeträge bei der Steuer hast, ...
Vielleicht war auch ein Teil des geplanten Lohnes ein Fahrtwegsbonus zu der Firma, wo Du hättest eingesetzt werden sollen - der fällt natürlich im Krankheitsfalle weg. Oder Zuschläge für Schichtarbeit, insbesondere Nachtschichten - dto.
Wenn Du Dir nicht sicher bist, lass Dich von Fachleuten beraten, die vor allem dazu auch den Arbeitsvertrag und die Gehaltsabrechnung in der Hand haben, ohne das beides kann man Deine Frage nicht beantworten.