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Wenn er die Finanzen trennen möchte, dann soll er das doch bitte auch konsequent durchziehen, sprich Lohnsteuerklasse 4 für beide.
Auf Lohnsteuerklasse 3 und 5 würde ich mich nur bei gemeinsamen Finanzen einlassen (oder wenn Nachwuchs in Planung ist, dann allerdings die 3 für denjenigen, der Elternzeit nimmt).